27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2481 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.03219e-17  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU2374  hypothetical protein  72.55 
 
 		 204 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0158703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3287  hypothetical protein  64.29 
 
 		 215 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1165  hypothetical protein  54.59 
 
 		 215 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1240  hypothetical protein  53.03 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3320  hypothetical protein  51.14 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0926  hypothetical protein  50.68 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.084000000000001e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 587 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  29.17 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 618 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  29.57 
 
 		 442 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 544 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  34.18 
 
 		 558 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  32.98 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 		 638 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.91 
 
 		 557 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 		 547 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  40 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  40 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  39.44 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  39.44 
 
 		 261 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 238 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>