13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1165 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1240  hypothetical protein  61.33 
 
 		 227 aa  244  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3287  hypothetical protein  59.79 
 
 		 215 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2481  hypothetical protein  54.59 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.03219e-17  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU2374  hypothetical protein  54.5 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0158703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3320  hypothetical protein  55.88 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0926  hypothetical protein  46.54 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.084000000000001e-35 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  40.26 
 
 		 669 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 322 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 		 669 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.21 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 		 587 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>