15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3320 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0926  hypothetical protein  94.32 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.084000000000001e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3287  hypothetical protein  57.08 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2481  hypothetical protein  51.14 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.03219e-17  normal  1 
 
 
 
NC_010814  Glov_1240  hypothetical protein  53.51 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1165  hypothetical protein  55.88 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2374  hypothetical protein  63.45 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0158703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 		 251 aa  45.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  31.54 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  28.09 
 
 		 461 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3070  Lytic transglycosylase catalytic  39.13 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32809  normal  0.422558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>