256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2126 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2126  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.935459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4213  transposase, IS4  98.8 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1106  transposase, IS4  71.95 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  98.18 
 
 		 250 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  58.67 
 
 		 308 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  55.26 
 
 		 275 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  50.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  50.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  50.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  50.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  53.52 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  50.67 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  62.16 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0958  hypothetical protein  60.94 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.496373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  49.33 
 
 		 278 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  50.77 
 
 		 265 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0787  IS5 family transposase  56.6 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4117  transposase, IS4  49.23 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  50.77 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  46.97 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  54.84 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  54.84 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  54.84 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1515  IS4 family transposase  50 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00015813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  50.77 
 
 		 265 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  46.48 
 
 		 279 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  46.48 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  46.48 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  51.61 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  47.69 
 
 		 254 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  50.91 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  40.32 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  47.69 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  47.69 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0172  transposase IS4  44.78 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660749  normal  0.461736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  50 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0079  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0801  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1019  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0443758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1363  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.26384  normal  0.0601879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1441  transposase IS4  44.78 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2642  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3318  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00325519  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3801  transposase IS4  46.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0534365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  47.62 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0149  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.776915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  46.15 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  46.88 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  47.69 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2486  transposase IS4  44.78 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915363  normal  0.0938271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  45.9 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  47.62 
 
 		 280 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  47.62 
 
 		 274 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  47.62 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  47.62 
 
 		 274 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  47.62 
 
 		 274 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  47.62 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  47.62 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  47.69 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  43.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  46.03 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  41.54 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  41.54 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  40 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  48.21 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>