22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3055 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1318    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3325  hypothetical protein  24.49 
 
 		 630 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.275699  hitchhiker  2.24064e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2148  hypothetical protein  21.58 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  24.12 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  23.97 
 
 		 641 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  22.14 
 
 		 664 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5326  hypothetical protein  19.04 
 
 		 644 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2049  hypothetical protein  24.5 
 
 		 631 aa  51.2  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.977561  hitchhiker  0.00020723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0809  hypothetical protein  20.88 
 
 		 646 aa  51.2  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  32.53 
 
 		 619 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3545  hypothetical protein  25.61 
 
 		 662 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.011877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  38.18 
 
 		 559 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  23.79 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  24.84 
 
 		 646 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  40.35 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  20.44 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  38.89 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  42 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  26.71 
 
 		 621 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  35.38 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05007  exonuclease  22.69 
 
 		 627 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  26.04 
 
 		 652 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>