16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3545 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3545  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1318    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.011877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2170  hypothetical protein  24.96 
 
 		 676 aa  160  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.569877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0243  hypothetical protein  25.64 
 
 		 681 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3154  hypothetical protein  24.51 
 
 		 679 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3840  hypothetical protein  26.04 
 
 		 682 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.542873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2667  hypothetical protein  24.41 
 
 		 678 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  23.26 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  23.85 
 
 		 646 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  25.61 
 
 		 655 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  21.16 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 		 1196 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.48 
 
 		 1196 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  30.48 
 
 		 1196 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  51.35 
 
 		 1099 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  21.24 
 
 		 634 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1189 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>