14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2939 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2049  hypothetical protein  52.7 
 
 		 631 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.977561  hitchhiker  0.00020723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1305    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  48.87 
 
 		 634 aa  590  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0809  hypothetical protein  30.77 
 
 		 646 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1219  hypothetical protein  31.56 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  27.94 
 
 		 641 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  24.69 
 
 		 646 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5326  hypothetical protein  24.47 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4583  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0563386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3509  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  24.12 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3325  hypothetical protein  22.66 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.275699  hitchhiker  2.24064e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2667  hypothetical protein  21.97 
 
 		 678 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1226  hypothetical protein  50 
 
 		 43 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.257925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>