14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2049 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1297    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.977561  hitchhiker  0.00020723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  52.7 
 
 		 631 aa  673    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  46.67 
 
 		 634 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0809  hypothetical protein  33.23 
 
 		 646 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1219  hypothetical protein  34 
 
 		 624 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  28.64 
 
 		 641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5326  hypothetical protein  23.05 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4583  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0563386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3509  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  22.97 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  24.5 
 
 		 655 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1227  hypothetical protein  31.18 
 
 		 592 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  29.32 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4459  hypothetical protein  28.77 
 
 		 622 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>