12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3986 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1301    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  48.87 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2049  hypothetical protein  46.67 
 
 		 631 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.977561  hitchhiker  0.00020723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0809  hypothetical protein  31.44 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1219  hypothetical protein  31.14 
 
 		 624 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  27.55 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4583  hypothetical protein  39.51 
 
 		 96 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0563386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3509  hypothetical protein  39.51 
 
 		 96 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  22.87 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  20.44 
 
 		 655 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3545  hypothetical protein  20.72 
 
 		 662 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.011877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1226  hypothetical protein  50 
 
 		 43 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.257925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>