14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0719 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0719  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1305    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2049  hypothetical protein  28.64 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.977561  hitchhiker  0.00020723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2939  hypothetical protein  27.94 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0809  hypothetical protein  27.91 
 
 		 646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3986  hypothetical protein  27.55 
 
 		 634 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.946958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1219  hypothetical protein  27.75 
 
 		 624 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3545  hypothetical protein  22.84 
 
 		 662 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.011877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  23.97 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0790  hypothetical protein  28.24 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.899701  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4583  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0563386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3509  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4201  hypothetical protein  22.41 
 
 		 646 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1226  hypothetical protein  41.86 
 
 		 43 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5326  hypothetical protein  23.88 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>