14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3388 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1365    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  39.4 
 
 		 665 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  31.91 
 
 		 656 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  25.23 
 
 		 639 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  25.96 
 
 		 649 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  24.82 
 
 		 667 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  23.18 
 
 		 619 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  24.78 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  23.66 
 
 		 616 aa  101  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  24.6 
 
 		 652 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  24.81 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  29.89 
 
 		 660 aa  77.4  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  30.77 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  40.35 
 
 		 655 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>