14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0833 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1274    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  28.18 
 
 
619 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  24.34 
 
 
616 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  26.11 
 
 
616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  23.26 
 
 
639 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  23.99 
 
 
656 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  28.02 
 
 
665 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  24.81 
 
 
668 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  22.07 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  19.22 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  33.8 
 
 
649 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  23.2 
 
 
667 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  24.12 
 
 
664 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  26.71 
 
 
655 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>