14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4535 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1382    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  58.83 
 
 		 664 aa  812    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  34.61 
 
 		 660 aa  352  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  24.82 
 
 		 668 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  23.6 
 
 		 656 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  23.14 
 
 		 665 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  23.38 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  24.67 
 
 		 649 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  23.1 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  22.89 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  23.2 
 
 		 621 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  29.36 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  41.07 
 
 		 553 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  41.07 
 
 		 553 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>