14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0805 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 652 aa  1316    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  27.38 
 
 		 639 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  26.14 
 
 		 656 aa  150  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  27.46 
 
 		 649 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  23.52 
 
 		 619 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  24.96 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  25.22 
 
 		 665 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  18.84 
 
 		 660 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  22.93 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  20.06 
 
 		 621 aa  74.3  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  27.63 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  25 
 
 		 616 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  21.7 
 
 		 664 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  26.04 
 
 		 655 aa  43.9  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>