11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1751 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  100 
 
 		 616 aa  1266    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  30.14 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  27.61 
 
 		 616 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  26.11 
 
 		 621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  26.19 
 
 		 656 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  23.66 
 
 		 668 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  22.34 
 
 		 665 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  23.45 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  25.38 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  23.4 
 
 		 652 aa  47.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  44.23 
 
 		 664 aa  44.3  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>