17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0472 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  58.83 
 
 
667 aa  812    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  100 
 
 
664 aa  1378    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  36.09 
 
 
660 aa  369  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  25.33 
 
 
639 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  24.41 
 
 
649 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  25 
 
 
656 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  21.8 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  30.77 
 
 
668 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  22.14 
 
 
655 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0018  hypothetical protein  52.17 
 
 
216 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.364832  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  21.77 
 
 
652 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1227  hypothetical protein  46.94 
 
 
592 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  23.22 
 
 
619 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  24.12 
 
 
621 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  21.89 
 
 
616 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  44.23 
 
 
616 aa  44.3  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1107  hypothetical protein  21.27 
 
 
610 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.948524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>