14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0839 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0839  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1271    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3809  hypothetical protein  36.12 
 
 		 616 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000888518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1751  AYP/GTP-binding protein  30.14 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_002950  PG0833  hypothetical protein  28.18 
 
 		 621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.44274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3362  hypothetical protein  26.07 
 
 		 665 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3388  hypothetical protein  23.18 
 
 		 668 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1501  hypothetical protein  22.87 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.33375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3113  plasmid-related protein  22.75 
 
 		 649 aa  94.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  28.85 
 
 		 656 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0805  hypothetical protein  21.89 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4535  hypothetical protein  23.1 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0209  hypothetical protein  36.49 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0547136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  32.53 
 
 		 655 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0472  hypothetical protein  23.22 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.138177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>