21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05007 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05007  exonuclease  100 
 
 
627 aa  1275    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2148  hypothetical protein  27.88 
 
 
608 aa  210  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4891  hypothetical protein  26.55 
 
 
602 aa  208  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.981822 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4459  hypothetical protein  24.01 
 
 
622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1227  hypothetical protein  26.02 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0015  hypothetical protein  27.34 
 
 
428 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.902002  hitchhiker  0.00321286 
 
 
-
 
NC_002936  DET1107  hypothetical protein  25.53 
 
 
610 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.948524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0018  hypothetical protein  33.97 
 
 
216 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.364832  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0312  hypothetical protein  30.12 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.258797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3325  hypothetical protein  26.7 
 
 
630 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.275699  hitchhiker  2.24064e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  22.69 
 
 
655 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  47.37 
 
 
1189 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>