13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2148 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2148  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1243    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4459  hypothetical protein  31.94 
 
 
622 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05007  exonuclease  27.88 
 
 
627 aa  206  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4891  hypothetical protein  29.72 
 
 
602 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.981822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1227  hypothetical protein  24.76 
 
 
592 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0015  hypothetical protein  27.16 
 
 
428 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.902002  hitchhiker  0.00321286 
 
 
-
 
NC_002936  DET1107  hypothetical protein  21.09 
 
 
610 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.948524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  102  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.364832  normal  0.0206421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3055  hypothetical protein  21.58 
 
 
655 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0206924  hitchhiker  0.00000001021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0312  hypothetical protein  37.84 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.258797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.37 
 
 
813 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  30 
 
 
814 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2023  hypothetical protein  22.82 
 
 
656 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.446279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>