65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1773 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1773  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0610  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  51.92 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0596  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  51.92 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000617065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2559  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  42.03 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000186717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3259  hypothetical protein  38.78 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226697  normal  0.438812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0423  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.05 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0040  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.57 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.87 
 
 		 619 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.28 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1382  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.34 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000585397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  26.32 
 
 		 628 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3481  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117501  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1794  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.82 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3955  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.95 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2721  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.47 
 
 		 627 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.49 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.68 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.78 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4704  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.21 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2685  TrapT dctQ-M fusion permease, dicarboxylate transport  28.47 
 
 		 627 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0788  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.69 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2025  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  25 
 
 		 627 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.87 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3644  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  31.46 
 
 		 620 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1833  putative TRAP transporter  26.81 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.14 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0560  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  31.17 
 
 		 625 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6903  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  30.85 
 
 		 625 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  24.79 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3078  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.87 
 
 		 632 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1536  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  25 
 
 		 638 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0822  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.41 
 
 		 628 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0034  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.62 
 
 		 627 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3901  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.58 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.507253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4815  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  32.94 
 
 		 616 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.961579  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2369  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.22 
 
 		 628 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193075  normal  0.0167467 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2122  ArsR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0479632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.23 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2094  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  24.22 
 
 		 628 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386051  normal  0.0954493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1549  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component-like  29.5 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3006  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.48 
 
 		 630 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3120  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.87 
 
 		 627 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.525657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1376  hypothetical protein  24.81 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5667  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.08 
 
 		 622 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5222  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  23.72 
 
 		 634 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0439  TRAP dicarboxylate transporter, fused DctM (12TM) and DctQ (4TM) subunits  36.11 
 
 		 628 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7228  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.36 
 
 		 628 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1743  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  23.89 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.89 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0344722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3117  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.01 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.573948  hitchhiker  0.000638451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3751  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.88 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1318  C4-dicarboxylate transport system, small subunit  28.47 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000464953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2410  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.34 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.932493  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2741  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.19 
 
 		 626 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359375  normal  0.0328397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3271  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  27.82 
 
 		 619 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373435  normal  0.294977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0263  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  23.44 
 
 		 624 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3543  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.05 
 
 		 165 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.186116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.21 
 
 		 192 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1590  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.71 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0330  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  26.15 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5261  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.87 
 
 		 636 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2292  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.53 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6354  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.81 
 
 		 623 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.522934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1050  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  28.57 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1947  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  23.85 
 
 		 635 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>