210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0908 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  81.06 
 
 		 134 aa  202  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  67.18 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  65.91 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  65.65 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  58.02 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  53.38 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  59.38 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  54.2 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 177 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  32.82 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  35.34 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  37.82 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  35.34 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  31.54 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  32.76 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  32.31 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  31.9 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  28.68 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  30.77 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  32.76 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  31.5 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  32.8 
 
 		 174 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  31.71 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  31.58 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  28.79 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  29.03 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  28.46 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  28.24 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  31.4 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  28.79 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  28.46 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  28.79 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  29.37 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  32.5 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  27.59 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  28.89 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  31.62 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  30.43 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  31.62 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>