217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4157 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  65.69 
 
 		 175 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  65.69 
 
 		 175 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  63.43 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  64.71 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  60.58 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 138 aa  179  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  64.34 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  65.35 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  60.14 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  60 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  60 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  64.39 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  61.03 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  60.77 
 
 		 145 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  60.31 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  58.65 
 
 		 158 aa  156  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  62.02 
 
 		 166 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  56.91 
 
 		 185 aa  154  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  62.1 
 
 		 162 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  63.41 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  62.2 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  62.3 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  58.96 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  58.21 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  55.91 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  55.81 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  60.31 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  57.85 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  56.91 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  55.71 
 
 		 173 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  58.02 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  56.69 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  57.03 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 158 aa  141  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 174 aa  141  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  53.85 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  54.01 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  60.16 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  57.04 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  56.49 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  54.33 
 
 		 165 aa  137  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  55 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 166 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  56.39 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  53.38 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  55.71 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>