216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1277 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  296  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  78.32 
 
 		 143 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  78.32 
 
 		 143 aa  239  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  77.3 
 
 		 143 aa  235  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  60 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  55.8 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  58.14 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 154 aa  149  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 183 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  53.33 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  53.33 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  56.15 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  57.03 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  53.91 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  54.33 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  56.2 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  53.23 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  52.76 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  53.72 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 168 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  51.18 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  51.97 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  52.38 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  48.8 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  52.03 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  48.85 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  51.18 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  51.56 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  50.79 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  48.09 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  51.52 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  51.52 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  50.39 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  47.48 
 
 		 150 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  49.61 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  47.89 
 
 		 162 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  50.39 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  49.62 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  51.18 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  47.01 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  47.69 
 
 		 177 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  46.85 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  46.51 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  46.51 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  42.03 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>