215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1802 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  60.32 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  58.14 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 137 aa  143  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  51.97 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  51.2 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  53.17 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  53.17 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  51.16 
 
 		 137 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  51.56 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  50.75 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  49.26 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  54.17 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  48.82 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  50.79 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  49.21 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  49.21 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  47.62 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  46.62 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  48.76 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  49.19 
 
 		 133 aa  121  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  45 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  47.66 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  49.61 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  48.78 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  43.04 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  49.59 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  43.26 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  48.39 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 174 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  46.72 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  49.18 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  47.54 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  45.9 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  46.72 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  48.74 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  47.2 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  47.15 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  47.11 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  44.59 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  50.41 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  46.83 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  49.21 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  41.43 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  49.19 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  44.63 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  47.5 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>