211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1806 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  78.63 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  68.99 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  67.41 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  62.12 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  64.84 
 
 		 130 aa  173  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  59.7 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  55.64 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  55.97 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  56.82 
 
 		 133 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  53.38 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  53.03 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  30.3 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  31.54 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  30.23 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  28.69 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  28.69 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  34.86 
 
 		 160 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  29.77 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  31.34 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  27.91 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  29.32 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  29.32 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  29.27 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  35.16 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  28.57 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  30.47 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 174 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  31.15 
 
 		 166 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  32.79 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  29.13 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  29.75 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  29.66 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  30.25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  31.2 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  30.25 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  31.78 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  24.8 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  35.42 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  31.11 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  31.11 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  31.11 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0276  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  28.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>