178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2613 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  323  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  72.31 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 132 aa  189  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  71.65 
 
 		 130 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  63.85 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  65.87 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  61.94 
 
 		 133 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 128 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  58.46 
 
 		 130 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  57.25 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  57.81 
 
 		 134 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  56.06 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  53.03 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  28.46 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  34.23 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  30.58 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  31.25 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  31.58 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  31.58 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  28.24 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  26.52 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5483  transcriptional regulator, MucR family  25 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.596779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  25.76 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  26.19 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3329  transcriptional regulator, MucR family  28.99 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  26.42 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  25.76 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  21.48 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  27.48 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  24.62 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  25.17 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6382  MucR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6412  MucR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  25.58 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  25.76 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  21.8 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  23.97 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  24.82 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  28.23 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  25.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  24.82 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  25.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2438  ROSMUCR transcriptional regulator  24.03 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.634995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  24.39 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  24.39 
 
 		 176 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  21.05 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3829  transcriptional regulator, MucR family  31.58 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  21.05 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6452  MucR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  24.09 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  23.26 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  24.6 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6424  MucR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.537554 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  23.44 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3293  MucR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>