205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0295 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  75.78 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  74.22 
 
 		 130 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  69.29 
 
 		 132 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  66.93 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  60.63 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  62.02 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  59.84 
 
 		 133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  59.06 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  64.34 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  57.03 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  56.59 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  53.49 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  53.49 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  33.64 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  30.6 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  31.54 
 
 		 177 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  29.77 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  29.77 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  25.78 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  31.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  28.07 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  28 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  27.27 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  27.78 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  29.91 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  27.87 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  25.78 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  32.79 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  29.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  26.55 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  27.87 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  26.36 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  29.92 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  28.8 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6382  MucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  28.32 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6412  MucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3293  MucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  29.41 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  29.46 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  26.4 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  28.68 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  25 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  25.78 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  26.67 
 
 		 176 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  27.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>