186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2217 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 173 aa  294  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  79.17 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  79.17 
 
 		 186 aa  239  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  63.01 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 174 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  57.46 
 
 		 147 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  51.88 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  51.25 
 
 		 169 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  52.34 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  34.09 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  34.09 
 
 		 143 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 143 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  33.07 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  32.26 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  34.13 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  34.92 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  34.92 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2289  MucR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.365964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  32.57 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  28.46 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3611  MucR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  31.71 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  35.25 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  35.25 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  30 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  35.66 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  33.11 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  30.57 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  29.6 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  30.16 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  30.16 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  29.92 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  32.28 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  33.06 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  26.06 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  28.86 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  31.76 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  32.54 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  31.13 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  31.15 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  30.89 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  32.26 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  27.16 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  32.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>