200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3088 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 169 aa  339  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  98.82 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  79.72 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  67.9 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  57.64 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  57.33 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  54.66 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 148 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  54.61 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  53.9 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  53.9 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  36.29 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  36.29 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  36.29 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2289  MucR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.365964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  34.4 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  33.86 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  32 
 
 		 137 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  32.81 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  34.4 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  32.52 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3611  MucR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  30.97 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  32.54 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  32.12 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  33.07 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  33.06 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  30.23 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  31.79 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  29.77 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  29.77 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  32.26 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  31.25 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  30.71 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  31.82 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  32.52 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  30.41 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  31.5 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  28.12 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  31.17 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4852  MucR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  30.47 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  30.47 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  32.52 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  33.07 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>