203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3611 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3611  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2289  MucR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.365964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  41.56 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  38.06 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  39.47 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  36.71 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  36.6 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  36.6 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  35.9 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  33.55 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  40.38 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  37.84 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  38.67 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  34.21 
 
 		 138 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  40.26 
 
 		 177 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  39.1 
 
 		 178 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  34.23 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  34 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  35.57 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  32.47 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  36.81 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  34.67 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  36.49 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  36.24 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  39.19 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  39.19 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  36.73 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  34.9 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  34.87 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  34.67 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5531  transcriptional regulator, MucR family  37.01 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0316462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  35.1 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  32.91 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0270  transcriptional regulator, MucR family  36.73 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  36.18 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  34 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  34.23 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  34.87 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  32.45 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  35.06 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  33.55 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  32.21 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  31.54 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  34.42 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  36.55 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  33.11 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  32.68 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  33.11 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>