213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2317 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  58.99 
 
 		 185 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  58.27 
 
 		 173 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  55.07 
 
 		 186 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  55.07 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  50.72 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  51.45 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  51.49 
 
 		 169 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  50.75 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  44.27 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  34.33 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  34.33 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 155 aa  85.9  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3611  MucR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  33.86 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  34.88 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  35.66 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  31.82 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2289  MucR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.365964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  33.59 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  35.11 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  33.85 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  33.85 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  31.01 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5176  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  36.76 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  31.79 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  30.23 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  31.25 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  28.89 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  28 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  28 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  32.41 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  32.41 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  31.47 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  29.46 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  29.46 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  30.56 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  32.03 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  31.01 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  31.78 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 308 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  30.77 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  32.03 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>