211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0298 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  270  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  78.63 
 
 		 133 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  75 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  67.19 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  62.88 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  58.33 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  60.31 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  58.46 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  57.89 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  53.44 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  54.2 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  29.51 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  29.51 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  34.23 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  32.23 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  33.06 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  28.68 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  27.13 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  27.91 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  27.91 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  28 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 181 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  28.1 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  29.03 
 
 		 186 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  28.93 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  28.46 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  28.46 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  31.45 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  28.23 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  28.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  28.46 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  29.84 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  27.64 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  26.92 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  26.52 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  30.51 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  25.95 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  28.12 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  26.42 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  27.2 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  26.61 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  26.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6412  MucR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  26.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6382  MucR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  28.46 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5483  transcriptional regulator, MucR family  26.09 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.596779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  33.64 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  28.46 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  34.02 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  31.09 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>