213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0717 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  266  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  83.08 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  72.87 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 130 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  64.39 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  70.87 
 
 		 130 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  67.18 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  61.07 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  61.54 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  58.78 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  58.78 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 135 aa  154  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  58.02 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  56.39 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  32.06 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  33.81 
 
 		 177 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  27.48 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  37.84 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  37.84 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  28.91 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  31.85 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  28.91 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  32.85 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  35.19 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  29.6 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  28.91 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  28.12 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  30.53 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  30.47 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  30.58 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  30.89 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  29.6 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  29.6 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3329  transcriptional regulator, MucR family  30.16 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  32 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  29.27 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  28.79 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  28.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  29.27 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  31.67 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  27.48 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3829  transcriptional regulator, MucR family  31.75 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  28.8 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  29.91 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  26.72 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  31.36 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  29.6 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  26.72 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  28.91 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  26.85 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  30.37 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  30.37 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  32.2 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>