213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1302 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  69.23 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  62.12 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  61.72 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  57.58 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  57.25 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  55.73 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  54.2 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  51.91 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  31.3 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  34.92 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  34.92 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 172 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 172 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  34.85 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  36.7 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  32.03 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  29.01 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  27.91 
 
 		 175 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  29.46 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  29.41 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  28.68 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  32.26 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  31.13 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2438  ROSMUCR transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.634995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  30.33 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  39.71 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  37.84 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  36.11 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 178 aa  57  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  28.69 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  34.41 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  39.39 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  30.84 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  29.01 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  30.19 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  27.13 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  30.19 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  31.45 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  29.37 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  36.11 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  27.2 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  28.8 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>