210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1281 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  90.08 
 
 		 134 aa  244  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  72.87 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  65.15 
 
 		 133 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  65.65 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  65.87 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  60.31 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  59.69 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  56.82 
 
 		 133 aa  157  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  55.73 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  42.34 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  37.3 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  36.51 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  33.59 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  31.78 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  37.5 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  30.33 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  31.45 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  31.45 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  32.54 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  35.25 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  30.23 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  30.6 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  30.95 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  30.88 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  31.09 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  31.3 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  35 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  29.32 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  31.71 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  29.32 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3293  MucR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  31.3 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  31.3 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  30.83 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  30.58 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  28.91 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  30.71 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  32.76 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  34.58 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  32.56 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  30.71 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>