209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0874 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  61.94 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  55.97 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  58.52 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  53.73 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  56.3 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  53.33 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  54.07 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  56.59 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  54.48 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  38.05 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  25.98 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  32 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  29.41 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  27.78 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  28.35 
 
 		 175 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  32.31 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  24 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  29.03 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  24 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6382  MucR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6412  MucR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  24 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  25.4 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  26.05 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  26.72 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  27.56 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  30.77 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  25.6 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  27.78 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  30.77 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6410  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  26.28 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6380  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  25.81 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  30.58 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  31.45 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  26.45 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  29.66 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  30.16 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  28 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  27.13 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  30.16 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  32 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  28.69 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  29.03 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6452  MucR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3329  transcriptional regulator, MucR family  27.34 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  30.7 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  29.82 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5566  transcriptional regulator, MucR family  37.68 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.015516  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  28.69 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  28.16 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  25.78 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  30.58 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>