95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0053 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  100 
 
 
402 aa  823    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  35.29 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  32.24 
 
 
407 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  31.98 
 
 
389 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  26.98 
 
 
392 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  28.39 
 
 
392 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  26.33 
 
 
380 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  28.21 
 
 
411 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  28.18 
 
 
401 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  26.22 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  28.17 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  26.7 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  24.05 
 
 
394 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  26.42 
 
 
419 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  27.91 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  24.1 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  25.88 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  24.08 
 
 
474 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  24.48 
 
 
423 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  23.8 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  23.28 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  22.87 
 
 
391 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  25.62 
 
 
325 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  24.05 
 
 
429 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.8 
 
 
383 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  22.14 
 
 
395 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  23.44 
 
 
384 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  23.44 
 
 
384 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  24.82 
 
 
436 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  24.76 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  22.9 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  25.78 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  23.84 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.89 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  22.34 
 
 
397 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  22.84 
 
 
397 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  22.7 
 
 
397 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  22.45 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  22.45 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  22.06 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  21.86 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  22.78 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  22.58 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  22.03 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  22.09 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  21.11 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  21.11 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  22.14 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  21.77 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  25.2 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  23.88 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  22.22 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  21.89 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  19.74 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  22.46 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  20.92 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  21.2 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  22.14 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  22.14 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  18.86 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  22.28 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  22.14 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  21.9 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  21.9 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  22.47 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  20.16 
 
 
361 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  22.33 
 
 
359 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  20.82 
 
 
359 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  22.33 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0158  spore germination protein xc  29.2 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  22.33 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  22.33 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  22.49 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  20.19 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  21.79 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  20 
 
 
361 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  20.68 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4516  GerAC  22.47 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1963  germination protein, Ger(x)C family  20.68 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0735591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  20.63 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  20.63 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3071  hypothetical protein  26.2 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  21.47 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  20.39 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2513  germination protein, Ger(x)C family  29.25 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  20 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.38 
 
 
374 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  19.9 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  20 
 
 
359 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0818  spore germination protein, GerC family  21.1 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  20.32 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0642  spore germination B3 GerAC family protein  19.06 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0925  spore germination protein AC  20.78 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0689  spore germination protein GerKC  25.81 
 
 
206 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>