78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0669 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  100 
 
 		 436 aa  890    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  32.64 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  33.5 
 
 		 381 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  33.82 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  29.16 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  31.88 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  26.3 
 
 		 419 aa  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  26.56 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  26.57 
 
 		 389 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  22.77 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  25.42 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  25.18 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  22.54 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  23.57 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  26.05 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.54 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  25 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  26.69 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  25.17 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  26.32 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  21.37 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  23.28 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  25.42 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  21.34 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  24.45 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.2 
 
 		 388 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  21.23 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.64 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  23.62 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  22.05 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  21.82 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  20.95 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  21.82 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  22.17 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  22.14 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  21.82 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  21.32 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  20.61 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  21.23 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  21.34 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  21.82 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  21.82 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  21.82 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  20.61 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  22.2 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  27.34 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  20.96 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  21.63 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  21.48 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  21.24 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  21.24 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  25.37 
 
 		 374 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  23.29 
 
 		 379 aa  53.5  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1963  germination protein, Ger(x)C family  20.68 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0735591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  20.96 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  21.39 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  23.94 
 
 		 325 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  22.53 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  19.71 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  26.46 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  22.81 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  23.25 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  19.76 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  21.61 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  25.65 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  20.33 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  22.03 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  20.24 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1559  hypothetical protein  28.39 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.102998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  21.61 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  20.57 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  21.5 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  21.36 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  25.93 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  25.93 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  21.86 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0663  hypothetical protein  19.23 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  25.4 
 
 		 374 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>