71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0077 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  40.49 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  30.48 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  29.03 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  28.02 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  27.91 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  24.94 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  26.84 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  26.85 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  25.06 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  27.48 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  24.87 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  24.74 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  25.45 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  26.15 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  24.67 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  22.66 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  23.96 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  26.54 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  24.46 
 
 		 394 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.44 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  23.25 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  21.7 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  21.7 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  26.14 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  22.4 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  23.36 
 
 		 325 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  20.31 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  24.32 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  24.32 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  24.32 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  24.32 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  23.35 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  25.74 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  23.26 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  20.95 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  24.74 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  25 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  24.32 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  22.53 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  22.89 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  23.7 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  20.66 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  23.33 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  22.53 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  25.44 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  22.53 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  22.53 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  22.04 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  20.95 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  20.84 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  21.57 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  22.14 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  23.02 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  22.65 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0663  hypothetical protein  20.7 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3071  hypothetical protein  19.71 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  21.28 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  18.99 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1559  hypothetical protein  18.7 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.102998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  21 
 
 		 374 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  20 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  23.08 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  20.8 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  20.82 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  20.82 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  21.11 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  21.45 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  20.63 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  20.82 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0158  spore germination protein xc  18.86 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>