64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2280 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
391 aa  796    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  27.02 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  24.23 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  24.05 
 
 
397 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  24.24 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  24.74 
 
 
389 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  25.3 
 
 
407 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  22.34 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  24.76 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  26.63 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  25.72 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.7 
 
 
383 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  23.61 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  23.18 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  24.61 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  22.2 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  23.33 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  23.02 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  22.14 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  21.94 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  22.45 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  22.08 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  22.08 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  23.81 
 
 
474 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  22.85 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  24.02 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  21.74 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  22.44 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  21.91 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  20.31 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  22.56 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  24.52 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  23.97 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  23.97 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  20.77 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  22.08 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  20.73 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  21.79 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  21.37 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  21.12 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  21.12 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  21.37 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  21.32 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  22.47 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  22.08 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  20.91 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  22.7 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  23.1 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  22.45 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  22.45 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  22.19 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  20.36 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  22.19 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  20.45 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  20.55 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  21.79 
 
 
423 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  18.83 
 
 
359 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  22.08 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  20.44 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1632  spore germination protein  24.79 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  20.57 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  20.21 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  18.5 
 
 
359 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  21.66 
 
 
436 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>