105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2165 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
397 aa  800    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  47.49 
 
 
411 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  48.28 
 
 
402 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  34.88 
 
 
395 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  30.71 
 
 
407 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  29.04 
 
 
401 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  29.48 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  30 
 
 
394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  27.96 
 
 
474 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  31.47 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  28.76 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  31.22 
 
 
392 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  28.43 
 
 
399 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  26.89 
 
 
392 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  28.17 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  26.63 
 
 
402 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  27.85 
 
 
391 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  27.15 
 
 
380 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  26.67 
 
 
374 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  26.7 
 
 
381 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  29.18 
 
 
325 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  26.8 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  26.43 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  23.88 
 
 
391 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  27.81 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  24.09 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  26.07 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  27.46 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  25.31 
 
 
429 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  24.76 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  24.76 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  24.76 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  24.52 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.81 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  23.54 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  24.44 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  24.71 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  23.38 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  23.94 
 
 
397 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  24.75 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  23.83 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  23.53 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  23.96 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  25.53 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1707  GerZC  23.87 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000190927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  23.81 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  23.96 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  22.82 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  23.47 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  21.89 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  23.49 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  21.98 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  21.98 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  24.21 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2339  spore germination B3 GerAC family protein  23.6 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00709674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  22.96 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  22.83 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  22.83 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  23.27 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  26.04 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3071  hypothetical protein  26.51 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  23.48 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  22.76 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  26.56 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  26.56 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  22.87 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  25.78 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  20.68 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  22.48 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  22.48 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  21.96 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  23.31 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  22.74 
 
 
361 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  22.22 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  22.74 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0664  spore germination protein AC  23.51 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  23.45 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  21.28 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2513  germination protein, Ger(x)C family  21.77 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  23.56 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0676  spore germination protein (GerAC)  22.14 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  22.91 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  22.52 
 
 
374 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0676  spore germination B3 GerAC family protein  22.96 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  22.28 
 
 
374 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  29.46 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  22.28 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0158  spore germination protein xc  24.75 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  22.28 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0642  spore germination B3 GerAC family protein  21.82 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.48 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  21.28 
 
 
359 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  26.92 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  22.92 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0689  spore germination protein GerKC  25.38 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2926  spore germination protein BC, N-terminus  27.66 
 
 
212 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.250034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  21.26 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0726  spore germination protein GerYC  21.37 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0762  spore germination protein GerYC  21.37 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0212  germination protein, Ger  22.22 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>