60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1734 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  100 
 
 		 423 aa  881    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  34 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  31.58 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  27.06 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  26.65 
 
 		 381 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  23.32 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  24.76 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  22.14 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  23.75 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  24.21 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  24.5 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  25.12 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  20.79 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  21.23 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  24.56 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  21.76 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  23.99 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  23.9 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  23.36 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  22.09 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  25.85 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  23.75 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  23.75 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  24.05 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  23.99 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  25.85 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  20.53 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.2 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  23.61 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  20.67 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  21.14 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  24.47 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  21.52 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  22.28 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  23.57 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  20.71 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  25.71 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  20.86 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  21.1 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  23.45 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  21.98 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  24.65 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  21.64 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  21.05 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  22.58 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  22.39 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  23.7 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  21.2 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  24.86 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  20.22 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2926  spore germination protein BC, N-terminus  25.15 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.250034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  24.93 
 
 		 321 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  22.22 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  22.33 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  18.15 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  18.27 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  21.34 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  23.08 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  23.08 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2513  germination protein, Ger(x)C family  22.22 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>