45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1969 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
437 aa  896    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  32.03 
 
 
436 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  32.36 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  28.1 
 
 
381 aa  179  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  29.54 
 
 
423 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  24.88 
 
 
419 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  27.53 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  24.58 
 
 
399 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  24.04 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  26.68 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  24.53 
 
 
389 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  23.65 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  26.84 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  21.71 
 
 
402 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  25.4 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  24.11 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  21.82 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.98 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  24.01 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  22.58 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  22.22 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  25.23 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  24.47 
 
 
374 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  24.71 
 
 
325 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  21.78 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  24.14 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  23.43 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.33 
 
 
388 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  25.06 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  26.34 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  22.12 
 
 
392 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  21.35 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  22.99 
 
 
391 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  22.99 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  23.81 
 
 
380 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  21.29 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  20.38 
 
 
359 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  20.74 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  24.65 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  23.53 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  25 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0663  hypothetical protein  22.19 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  20.72 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  21.51 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  22.57 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>