108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2666 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  100 
 
 
373 aa  754    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  24.3 
 
 
383 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  26.21 
 
 
402 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  24.73 
 
 
359 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  25.27 
 
 
359 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5575  spore germination B3 GerAC family protein  25.48 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.472253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  26.39 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  25.74 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  25 
 
 
361 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  25.07 
 
 
359 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  24.8 
 
 
359 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  24.8 
 
 
359 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0676  spore germination protein (GerAC)  25.82 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  22.64 
 
 
391 aa  92.8  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  24.73 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  24.24 
 
 
401 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  24.47 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0664  spore germination protein AC  25.55 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4516  GerAC  26.93 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  23.29 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  23.29 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  23.29 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  23.29 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  22.72 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.81 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0642  spore germination B3 GerAC family protein  24.26 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0676  spore germination B3 GerAC family protein  24.66 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0726  spore germination protein GerYC  26.92 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  23.4 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0762  spore germination protein GerYC  26.92 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0925  spore germination protein AC  26.54 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  22.31 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  23.71 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0818  spore germination protein, GerC family  26.54 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  22.52 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  23.75 
 
 
397 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  24.67 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  25.27 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  25.42 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  22.99 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  23.22 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  25.32 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  20.73 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3371  spore germination protein  24.15 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00333115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3635  spore germination protein  24.15 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3334  spore germination protein  24.15 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0935169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3584  spore germination protein  24.15 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  23.2 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  22.96 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  25.33 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0833  spore germination protein GerYC  26.09 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9712e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  22.96 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  22.96 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3592  spore germination protein  23.14 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3601  spore germination protein  23.14 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3284  spore germination protein  23.14 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  22.89 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  22.69 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3684  spore germination protein  23.06 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  26.73 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  21.95 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0150  spore germination protein C  24.53 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  21.26 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  21.61 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  25.91 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  23.71 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2458  germination protein, Ger(x)C family  23.95 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  21.27 
 
 
394 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  23.92 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  26.58 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  22.37 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0893  germination protein, Ger(x)C family  26.34 
 
 
481 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1632  spore germination protein  22.85 
 
 
378 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  25.99 
 
 
380 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  23.31 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  25.33 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  25.9 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2339  spore germination B3 GerAC family protein  21.68 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00709674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  23.37 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1707  GerZC  20.05 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000190927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  22.98 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  26.14 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  22.56 
 
 
429 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  23 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0234  spore germination protein, Ger  22.25 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  25.25 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  25.25 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  18.78 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  22.03 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  28.88 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  28.34 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  21.54 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  25.44 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  21.35 
 
 
437 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  19.75 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  27.81 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  22.37 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  22.37 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  24.49 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  22.74 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>