37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0630 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  100 
 
 		 374 aa  744    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  98.4 
 
 		 374 aa  735    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  21.35 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  21.95 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  20.72 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.6 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  22.55 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  22.73 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  19.74 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  24.2 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  22.46 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  22.46 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  22.46 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  24.78 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  21.22 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  20.5 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  23.66 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  21.7 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  20.66 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  19.73 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.48 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  21.64 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  20.63 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  20.77 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  22.41 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  23.71 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  27.34 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  19.57 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  23.38 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  23.38 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  20.83 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.83 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2513  germination protein, Ger(x)C family  22.22 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  19.89 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  20.69 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  19.48 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  22.07 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>