37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0616 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  98.4 
 
 		 374 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  100 
 
 		 374 aa  744    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  21.35 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  20.92 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  22.55 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  20.56 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  22.52 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.3 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  24.2 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  18.86 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  22.25 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  22.25 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  22.25 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  24.48 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  20.98 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  20.25 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  23.39 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  21.11 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  20.39 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  19.73 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.39 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  20.65 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  21.5 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  20.31 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  21.91 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  22.47 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  25.37 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  19.57 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  21.05 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2513  germination protein, Ger(x)C family  21.94 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  19.34 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  20.69 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  22.86 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  22.86 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  19.12 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  22.07 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.13 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>