74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0075 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  40.49 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  27.85 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  28.5 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  24.35 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  28.04 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  27.86 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  26.15 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  23.84 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  23.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  27.57 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  26.8 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  25.74 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  26.06 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  22.45 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  22.78 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  23.47 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  24.8 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  23.06 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  21.58 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  26.12 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  26.12 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  23.41 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  22.54 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  21.03 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  24.24 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  22.87 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  22.87 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  22.54 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  22.74 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  22.87 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  22.45 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  21.64 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  24.91 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  25.43 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  22.22 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  21.48 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  21.26 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.14 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  20.97 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  20.97 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  20.97 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  18.56 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  21.39 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  21.23 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  22.08 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  21.82 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  23.37 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  20.63 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  21.25 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  23.2 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  21 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  26.34 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  19.95 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  20.73 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  20.47 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  18.86 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  20.21 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0663  hypothetical protein  22.03 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  18.96 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  18.96 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  23.29 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0158  spore germination protein xc  21.28 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  19.69 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  25.19 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  19.42 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  19.42 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  22.61 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  18.73 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  18.33 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2925  spore germination protein BC, C-terminus  32.05 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.108244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  19.94 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0234  spore germination protein, Ger  21.78 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1963  germination protein, Ger(x)C family  22.13 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0735591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>