111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3013 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
380 aa  765    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  29.79 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  26.36 
 
 
392 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  26.33 
 
 
402 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  25.37 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  27.94 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  23.99 
 
 
401 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  27.44 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  25.52 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  23.69 
 
 
379 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  28.42 
 
 
397 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  21.5 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  25.45 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  27.63 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  25.41 
 
 
398 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  27.51 
 
 
397 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  25.95 
 
 
411 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  24.93 
 
 
402 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  27.25 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  27.25 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  23.79 
 
 
391 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  22.54 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  27.97 
 
 
397 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  28.24 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  21.4 
 
 
474 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  24.46 
 
 
381 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  22.99 
 
 
416 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  22.78 
 
 
325 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  23.96 
 
 
419 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  24.7 
 
 
423 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  22.63 
 
 
391 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.8 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  25.45 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  25.7 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  25.72 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  25.71 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1963  germination protein, Ger(x)C family  20.05 
 
 
383 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0735591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  24.87 
 
 
388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  25.76 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  25.7 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  23.76 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  25.7 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  23.69 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  24.05 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  24.05 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  23.78 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  23.78 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  24.09 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  23.04 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  23.02 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  25.96 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  21.2 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  23.14 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  23.14 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  25.26 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  23.75 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  23.42 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  22.75 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  22.22 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  22.76 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  22.13 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  22.25 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  22.25 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  22.25 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  19.44 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  23.04 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  23.53 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  23.53 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0676  spore germination protein (GerAC)  22.34 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  21.6 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  21.99 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1707  GerZC  21.49 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000190927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0664  spore germination protein AC  22.54 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  19.46 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  22.66 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.56 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  21.73 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0676  spore germination B3 GerAC family protein  22.81 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0762  spore germination protein GerKC  21.73 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0234  spore germination protein, Ger  22.66 
 
 
376 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  20.75 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0726  spore germination protein GerYC  22.97 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0762  spore germination protein GerYC  22.97 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  21.47 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  21.2 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  20.94 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  21.2 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  20.67 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  20.68 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  21.53 
 
 
431 aa  56.2  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  17.36 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2339  spore germination B3 GerAC family protein  20.6 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00709674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3601  spore germination protein  19.95 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3592  spore germination protein  19.95 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  22.78 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  18.77 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2926  spore germination protein BC, N-terminus  28.67 
 
 
212 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.250034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3371  spore germination protein  18.94 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00333115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3284  spore germination protein  19.7 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3635  spore germination protein  18.94 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>