42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1963 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1963  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
383 aa  790    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0735591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  20.75 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  18.97 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  18.45 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  20.93 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  22.96 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  19.65 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  21.97 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  20.8 
 
 
394 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  22.86 
 
 
325 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  21.09 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  17.36 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  17.36 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  17.04 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  17.04 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  19.64 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  19.95 
 
 
401 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  19.9 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  20.64 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  19.22 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  22.14 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  17.54 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  19.73 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  20.76 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  18.41 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  20.36 
 
 
431 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  19.48 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  25.62 
 
 
474 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  21.45 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  21.54 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  17.06 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  21.45 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  19.22 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  20.96 
 
 
379 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  21.45 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  20.31 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  20.68 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  21.19 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  20.51 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  19.69 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  19.88 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  17.29 
 
 
398 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>