75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1193 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  796    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  34.75 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  31.22 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  31.08 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  28.61 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  29.65 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  30.39 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  28.39 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  28.95 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  28.09 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  26.26 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  26.75 
 
 		 401 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  27.91 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  28.17 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  26.49 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  25.9 
 
 		 416 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  28.38 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  22.81 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  26.63 
 
 		 419 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  24.38 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  21.66 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2280  germination protein, Ger(x)C family  24.88 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.74 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  22.17 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  22.2 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  24.7 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  23.32 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  23.77 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  24.82 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  23.54 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  23.54 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  23.5 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  23.28 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  22.88 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  22.67 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  23.2 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  22.28 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  22.96 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  22.74 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2851  spore germination protein  22.8 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0226  spore germination protein XC  22.63 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000400797 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0247  spore germination protein XC  22.63 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.425235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  24.49 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  23.06 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  20.98 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  25.23 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  22.81 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  22.61 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2103  spore germination protein GerAC  23.26 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  20.73 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  20.47 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  20.47 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  23.99 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  22.53 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  22.95 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  21.61 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  22.06 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  23.95 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1954  germination protein, Ger(x)C family  21.16 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00684146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  20.33 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  23.49 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0616  GerABKA family spore germination protein  23.62 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.693765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0630  spore germination protein  22.83 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.635137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  19.6 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  20.9 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  19.75 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  18.66 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  18.66 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  18.66 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  18.53 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  22.37 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  20.76 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  20.1 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0546  spore germination B3 GerAC family protein  19.59 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  19.59 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>